Daktarin działa grzybobójczo na większość odmian drobnoustrojów wywołujących grzybice. Daktarin powoduje zanikanie upławów, a ponadto przywraca właściwą kwasowość pochwy, co sprzyja pojawieniu się na nowo prawidłowej flory bakteryjnej w pochwie. Daktarin stosuje się kobietom ciężarnym tuż przed rozwiązaniem w celu zapobieżenia infekcji grzybiczej jamy ustnej u noworodków.