Jodyna stosowana jest do odkażania skóry i błon śluzowych. Preparat niszczy bakterie, grzyby i toksyny. Jodyna denaturuje białka stanowiące składnik plazmy drobnoustrojów, co uniemożliwia mikroorganizmom ich przetrwanie. Bakteriobójcze działanie jodyny jest wzmocnione również przez jodowodór, który wytwarza się w zetknięciu jodu z wodą.
Preparat stosuje się w razie potrzeby do zmywania ran i otarć naskórka.
Częste stosowanie roztworów jodu na duże powierzchnie skóry może doprowadzić do nadczynności gruczołu tarczycy. Jodyny nie wolno stosować osobom uczulonym na jod, chorym na gruźlicę lub niewydolność krążenia.